吴毓麟（1871年－1944年）字秋舫。直隶省天津府天津县人，清末民初政治家、海军中将。

生平
1886年（光绪12年），他入天津海军学堂，6年后毕业。此后，他历任海军教练处教习、天津海军学堂教习。1894年（光绪20年），他就职于陆军部海军处。翌年起，他历任地方官僚、直隶路矿总办、邮传部官僚。1908年（光绪34年），他回到海军处任视察。辛亥革命爆发后，他随唐绍仪参加南北议和，任代表团顾问。

中华民国成立后的1913年（民国2年），他任大沽海军造船所所长，获授海军少将衔。翌年，他兼任直隶海巡及全省水陆警察事宜。1915年（民国4年），他转任北京政府的导准事务局局长、直隶改良河工筹备处处长。2年后，他被任命为北洋铁工厂厂长。

1918年（民国6年），他任川粤湘赣四省经略使（后改直鲁豫巡阅使）曹锟的咨议。1921年（民国10年）7月，他任京兆河工局局长，11月获授海军中将衔。翌年6月，他任津浦铁路管理局局长兼津浦铁路督办。同年9月，他署鲁案善后督办，参与收回胶澳铁路。

1923年（民国12年）1月，他在王正廷临时内阁署理交通总长。同月，他在张绍曾内阁正式任交通总长。1924年（民国13年）10月，第二次直奉战争直系败北，吴毓麟下野。以后他寓居天津。1930年代他从事各种实业活动。
1944年（民国33年），吴毓麟逝世。享年74岁。